“十五”之初，我國開始了以減輕農民負擔為中心，取消“三提五統(tǒng)”等稅外收費、改革農業(yè)稅收為主要內容的農村稅費改革。整個農村稅費改革大致分兩個階段。
第一階段(2000至2003年)，自2000年從安徽開始，通過逐步擴大試點省份，到2003年在全國全面鋪開，其主要內容是：取消鄉(xiāng)統(tǒng)籌、農村教育集資等專門向農民征收的行政事業(yè)性收費和政府性基金、集資，取消屠宰稅，取消統(tǒng)一規(guī)定的勞動義務工；調整農業(yè)稅和農業(yè)特產稅政策；改革村提留征收使用辦法。
第二階段（2004至2005年），2004年改革進入深化階段，其主要內容是：清理化解鄉(xiāng)村不良債務；取消牧業(yè)稅和除煙葉外的農業(yè)特產稅；實行取消農業(yè)稅試點并逐步擴大試點范圍，對種糧農戶實行直接補貼、對糧食主產區(qū)的農戶實行良種補貼和對購買大型農機具戶的農戶給予補貼；推進鄉(xiāng)鎮(zhèn)機構改革、農村義務教育和縣鄉(xiāng)財政體制改革。吉林、黑龍江8個省份全部或部分免征了農業(yè)稅，河北等11個糧食主產區(qū)降低農業(yè)稅稅率三個百分點，其他地方降低農業(yè)稅稅率一個百分點。2005年，全國有28個省份全面免征了農業(yè)稅，河北、山東、云南也按中央要求將農業(yè)稅稅率降到2%以下。
從2006年起，改革又將邁入一個新的階段，我國將全面取消農業(yè)稅。這比原定用五年時間取消農業(yè)稅的時間表，整整提前了三年。2001至2004年，全國共減免農業(yè)稅234億元,免征除煙葉外的農業(yè)特產稅68億元,核定農業(yè)稅災歉減免160億元，其中中央財政負擔了85億元，各級農業(yè)稅征收機關共落實社會減免50億元，落實種糧大戶等其他減免9億元。預計2005年全國進一步減輕農民負擔220億元。（稅務總局提供）
