為了落實海峽兩岸關系協(xié)會與海峽交流基金會日前簽署的《海峽兩岸知識產權保護合作協(xié)議》（以下簡稱《協(xié)議》）各項安排，國家知識產權局對1993年發(fā)布的《關于受理臺胞專利申請的規(guī)定》和《關于臺胞申請專利手續(xù)中若干問題的處理辦法》進行了修訂，于11月15日頒布了新的《關于臺灣同胞專利申請的若干規(guī)定》，對臺胞專利申請、審查程序，特別是臺灣地區(qū)優(yōu)先權的請求和審查程序作出了具體規(guī)定。該規(guī)章將于2010年11月22日起施行，即從該日起國家知識產權局將正式受理臺胞提出的要求享有臺灣地區(qū)優(yōu)先權的專利申請。
該規(guī)章規(guī)定，臺胞在臺灣地區(qū)專利主管機構第一次提出發(fā)明或者實用新型專利申請之日起十二個月內，或者第一次提出外觀設計專利申請之日起六個月內，又在國家知識產權局就相同主題提出專利申請的，可以要求享有其臺灣地區(qū)在先申請的優(yōu)先權。臺胞要求臺灣地區(qū)優(yōu)先權的，其在先申請的申請日應當在《協(xié)議》生效日后，即2010年9月12日（含當日）以后。申請人在請求書中聲明要求臺灣地區(qū)優(yōu)先權的，應當寫明在先申請的申請日和申請?zhí)枺懨髟芾頇C構為“臺灣地區(qū)”。在大陸地區(qū)沒有經常居所或者營業(yè)所的臺胞申請專利的，應當根據專利審查指南的規(guī)定委托專利代理機構辦理。
此外，規(guī)章規(guī)定了對臺灣地區(qū)優(yōu)先權請求的具體審查規(guī)則，這些規(guī)則和專利審查指南中有關優(yōu)先權的審查規(guī)定基本相同。
在《協(xié)議》商談過程中，兩岸業(yè)務部門也共同商討了將來建立兩岸優(yōu)先權證明文件電子交換途徑的可能性，以方便申請人要求兩岸優(yōu)先權。規(guī)章對此也預作了規(guī)定，即如果國家知識產權局將來依據有關協(xié)議，通過電子交換途徑獲得在先申請文件副本的，視為申請人提交了符合規(guī)定的在先申請文件副本。
《關于臺灣同胞專利申請的若干規(guī)定》的公布實施，將進一步方便臺胞在大陸申請并獲得專利保護，進一步促進兩岸專利領域的交流與合作。
2010年6月29日，海峽兩岸關系協(xié)會與海峽交流基金會簽署了《海峽兩岸知識產權保護合作協(xié)議》。該《協(xié)議》于2010年9月12日起生效。《協(xié)議》規(guī)定，兩岸同意本著平等互惠原則，加強兩岸知識產權保護方面的交流與合作，協(xié)商解決相關問題，提升兩岸知識產權的創(chuàng)新、應用、管理及保護水平。該《協(xié)議》還規(guī)定雙方同意依各自規(guī)定，確認對方專利、商標及品種權第一次申請日的效力，并積極推動作出相應安排，保障兩岸人民的優(yōu)先權權益。
