2009年7月18日，科技部與云南省人民政府在昆明舉行了第二次部省工作會商會議。全國政協(xié)副主席、科技部部長萬鋼，科技部黨組成員、副部長張來武；中共云南省委副書記、省長秦光榮，副省長和段琪等出席了會議。會議由科技部副部長張來武主持。
萬鋼部長在講話中充分肯定了云南省的科技工作，尤其是在科技創(chuàng)新環(huán)境營造、著力培育特色優(yōu)勢產(chǎn)業(yè)等方面所取得的重要突破。他指出，面對云南快速發(fā)展的新形勢、新機遇，科技部將以十七大精神為指引，以部省會商為平臺，進(jìn)一步加強與云南省的合作與互動，促進(jìn)云南科技創(chuàng)新。希望云南認(rèn)真貫徹落實《國務(wù)院關(guān)于發(fā)揮科技支撐作用 促進(jìn)經(jīng)濟平穩(wěn)較快發(fā)展的意見》，立足優(yōu)勢特色產(chǎn)業(yè)，調(diào)整投入結(jié)構(gòu)，集成資源，調(diào)動各方面積極性，提升科技在經(jīng)濟社會發(fā)展中的支撐作用；進(jìn)一步抓好生物資源開發(fā)、有色金屬、磷化工和煤化工、先進(jìn)制造等重點領(lǐng)域的跨越發(fā)展，重視重大專項等科技成果在這些領(lǐng)域的推廣和應(yīng)用；進(jìn)一步營造好科技創(chuàng)新氛圍，切實加強自主創(chuàng)新政策的落實，并在符合自身發(fā)展需求方面取得突破。
秦光榮省長在講話中首先感謝科技部對云南科技工作的大力支持。他指出會商制度建立兩年多來，云南省在制定和完善政策、加大財政科技投入、促進(jìn)科技與金融結(jié)合、擴大科技領(lǐng)域的開放合作及進(jìn)一步深化科技管理改革等方面進(jìn)行了探索和創(chuàng)新，有力地促進(jìn)了云南的科技進(jìn)步和科技工作，形成了上下聯(lián)動、橫向互動的工作格局。他指出云南將以此為契機，按照國家目標(biāo)和云南優(yōu)勢相結(jié)合的原則，進(jìn)一步深化與科技部的合作，圍繞議定書的主題和內(nèi)容，加強領(lǐng)導(dǎo)，增加投入，創(chuàng)新機制，狠抓落實，舉全省之力，確保與科技部合作共建的重大項目的實施和重點工作的開展，共同為建設(shè)創(chuàng)新型國家作出貢獻(xiàn)。
會上，科技部與云南省圍繞“共同推進(jìn)云南有色金屬新材料產(chǎn)業(yè)化基地建設(shè)”、“推動中藥現(xiàn)代化科技產(chǎn)業(yè)（云南）基地建設(shè)”、“繼續(xù)推進(jìn)云南特色動物資源實驗動物化開發(fā)及共享平臺建設(shè)”、“共同推進(jìn)云南省興邊富民科技支撐工作”、“優(yōu)化科技發(fā)展環(huán)境，加強體制機制創(chuàng)新”等合作重點進(jìn)行了深入溝通和交流。
