2008年，福建省計劃投資9.96億元對閩江流域水環(huán)境開展綜合整治，重點推進五大工程98個項目：
一．加快畜禽養(yǎng)殖污染整治。取締禁建區(qū)劃定后建設(shè)的養(yǎng)殖場和禁建區(qū)劃定前建設(shè)但于2006年底前仍未治理達標(biāo)的養(yǎng)殖場，防止出現(xiàn)污染反彈。大力推廣生物發(fā)酵舍“零排放”養(yǎng)殖技術(shù)。
二、加大環(huán)保基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)力度。認真落實省政府推進城市污水、垃圾處理產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的政策，重點解決污水管網(wǎng)和生活垃圾收運設(shè)施的配套和完善。計劃投入5.57億元，重點實施福州大學(xué)城污水處理廠擴建、閩侯縣等6個污水處理廠項目和長樂市、武夷山市等2個污水處理廠管網(wǎng)配套工程等。
三、做好重點水源保護。嚴格執(zhí)行飲用水源保護區(qū)劃定方案，計劃投入0.26億元，重點實施長樂炎山水源地等7個水源保護項目。
四、加強工業(yè)污染防治。依法督促經(jīng)省環(huán)保與經(jīng)貿(mào)部門共同確定的開展清潔生產(chǎn)企業(yè)按期完成清潔生產(chǎn)審核。計劃投入2.77億元，重點實施福州富成味精食品有限公司搬遷整治等44項污染防治和清潔生產(chǎn)項目，加快循環(huán)經(jīng)濟、生態(tài)工業(yè)園區(qū)發(fā)展。
五、促進生態(tài)建設(shè)。推進礦山整頓、生態(tài)林保護和自然保護區(qū)、梯級水電站等清理整頓，大力推進農(nóng)村生活污染治理。計劃投入0.67億元，重點實施光澤縣大坑螢石浮選廠治理等22個項目。
整治的主要目標(biāo)是：閩江流域省控監(jiān)測斷面水質(zhì)功能區(qū)達標(biāo)率90%以上。城市集中式飲用水水源地水質(zhì)基本達到功能要求，福州市、南平市、三明市集中式飲用水水源地水質(zhì)達標(biāo)率達95%以上，各市縣集中式飲用水水源地水質(zhì)達標(biāo)率達85%以上；各市、縣（區(qū)）完成COD總量削減目標(biāo)。
